環境汚染された近未来の都市に、遺伝子選別された無菌のエリート達が暮らす壁に囲まれた「ゲートシティー」がそびえている。シティーを守る女性士官候補生・美博は、ゲートの外から妹の特効薬を盗みにやってきた盗賊・輝人と戦い、撃退する。しかし、輝人は美博に強く惹かれ、たびたびゲートに侵入するようになる……。